これまで当財団で行ってきましたヒューマンサイエンス基礎研究事業、創薬科学総合研究事業、および厚生労働省で行ってきましたオーファンドラッグ開発研究事業に加え、それまで財団の一事業として推進してきましたエイズ医薬品等開発推進事業を統合し、創薬等ヒューマンサイエンス総合研究事業として実施してきました。2006年度からは新たに政策創薬総合研究事業として開始しました。
　2012年度からは政策創薬マッチング研究事業として官民共同研究に限定して実施します。